Pracownicy i doktoranci Centrum Wodnego SGGW reprezentują  dwie dyscypliny naukowe: inżynierię środowiska, górnictwo i energetykę oraz inżynierię lądową i transport. Działalność badawcza koncentruje się na budownictwie lądowym, budownictwie hydrotechnicznym, budownictwie sanitarnym, gospodarce surowcowej, geotechnice i inżynierii ekologicznej. Wszystkie realizowane zadania naukowe uwzględniają aspekty ochrony środowiska naturalnego, oddziaływania na środowisko i polityki zrównoważonego rozwoju.